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柳枝稷TIFY基因家族的鑒定與分析
關(guān)鍵詞：柳枝稷 tify基因家族 jaz
摘要：為探究TIFY基因家族在柳枝稷(Panicum virgatum)中的生物學(xué)功能,本研究運用生物信息學(xué)手段對柳枝稷基因組中的TIFY家族成員進行了鑒定,并對其染色體定位、進化與結(jié)構(gòu)特點、啟動子區(qū)順式作用元件、時空表達模式等進行了分析,且通過定量實驗驗證了JAZ亞家族部分成員的激素應(yīng)答與脅迫響應(yīng)特性。結(jié)果表明:48個柳枝稷TIFY基因分屬于ZML(7個)、TIFY(1個)與JAZ(40個)3個亞家族,分布在除染色體3以外的染色體上,且在染色體9成簇排列;柳枝稷TIFY基因按照進化關(guān)系及結(jié)構(gòu)特點可分為5組,每組內(nèi)的成員具有相似的基因結(jié)構(gòu)與保守基序組成;柳枝稷TIFY基因啟動子區(qū)存在多種脅迫響應(yīng)元件與激素信號調(diào)控元件,經(jīng)定量實驗證實PviTIFY10各成員在茉莉酸(jasmonic acid,JA)處理及鹽與干旱脅迫下反應(yīng)強烈;JAZ亞家族部分成員尤其是PviTIFY10b在花序與根的發(fā)育過程中有較高表達。根據(jù)以上結(jié)果推測TIFY基因家族可能在柳枝稷激素信號調(diào)控與脅迫防御反應(yīng)及生長發(fā)育等多方面發(fā)揮功能。
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