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OrchidBase 3.0:一個蘭花基因功能和基因組進化研究的數(shù)據(jù)庫
關鍵詞：蘭花 orchidbase 轉錄組 全基因組 小蘭嶼蝴蝶蘭
摘要：蘭科為被子植物的最大科,蘭科植物是經(jīng)濟價值非常高的世界性觀賞植物,其基因組學和轉錄組學數(shù)據(jù)可為進一步推動蘭花育種和研究提供幫助.本研究團隊在建立的OrchidBase1.0、2.0數(shù)據(jù)庫的基礎上,利用小蘭嶼蝴蝶蘭的全基因組數(shù)據(jù)建立了基于網(wǎng)頁版的OrchidBase3.0數(shù)據(jù)庫.OrchidBase3.0數(shù)據(jù)庫包含了小蘭嶼蝴蝶蘭基因組拼接支架序列的信息以及基因注釋、基因定位、基因結構、KEGG途徑和BLAST搜索等內(nèi)容;此外,該數(shù)據(jù)庫也提供了小蘭嶼蝴蝶蘭的基因序列和每千堿基讀數(shù)每百萬映射讀數(shù)(RPKM).OrchidBase3.0數(shù)據(jù)庫的在線資源可以通過網(wǎng)頁瀏覽、文本和BLAST搜索獲取,搜索結果會顯示在網(wǎng)站上并可供下載,用戶可通過該數(shù)據(jù)庫下載小蘭嶼蝴蝶蘭的基因組拼接支架序列及預測的基因和蛋白質(zhì)序列.orchidbase.itps.ncku.edu.tw為OrchidBase3.0數(shù)據(jù)庫的免費網(wǎng)站鏈接.
福建農(nóng)林大學學報·自然科學版雜志要求:
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