竹?魚微衛(wèi)星標記開發(fā)及跨物種擴增
關(guān)鍵詞：微衛(wèi)星標記 跨物種擴增
摘要：【目的】篩選高多態(tài)性竹?魚(Trachurus japonicus)微衛(wèi)星(SSR)標記,并驗證其在鲹科魚類中的通用性?！痉椒ā坎捎肧LAF-seq技術(shù)識別竹?魚基因組SSR標記,利用聚丙烯酰胺凝膠電泳和毛細管電泳篩選高多態(tài)性位點,并進行跨物種PCR擴增。【結(jié)果與結(jié)論】識別出43264個二至六堿基重復SSR標記,二、三堿基重復SSR標記較多(90.33%)。篩選出37個多態(tài)性的二、三堿基SSR位點,各位點的等位基因數(shù)為4~26,期望雜合度為0.481~0.935,多態(tài)信息含量為0.440~0.934。有30個位點符合哈迪-溫伯格平衡,且各位點間不存在連鎖不平衡現(xiàn)象。共有28個竹.魚SSR標記可在1種以上鲹科魚類中有效擴增,分別有24、21、20、19和11個SSR位點可在藍圓鲹(Decapterus maruadsi)、長身圓鲹(Decapterus macrosoma)、無斑圓鲹(Decapterus kurroides)、頜圓鲹(Decapterus macarellus)及金帶細鲹(Selaroides leptolepis)中穩(wěn)定擴增,可為竹?魚遺傳資源評估和部分鲹科魚類的系統(tǒng)進化分析提供重要遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)及有力的分析手段。
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