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中國流行的兩個進化分支C4亞型EV71病毒3D蛋白氨基酸變異分析
朱穎; 翁育偉 福建省疾病預防控制中心(福建省人獸共患病重點實驗室); 福建福州350001
關鍵詞：腸道病毒71型 3d蛋白 氨基酸 變異
摘要：目的分析不同進化分支腸道病毒71型(EV71)的3D蛋白氨基酸序列的差異,了解潛在毒力相關變異位點。方法從GenBank和實驗室收集C4基因亞型EV71全基因序列,以VP1序列做進化分析,統(tǒng)計分析C4a和C4b兩進化分支EV71病毒的3D蛋白氨基酸序列。結果共收集病毒序列301株C4型EV71毒株,其中C4a序列293株、C4b序列8株。不同進化分支中3D區(qū)有22個氨基酸殘基分布有統(tǒng)計學意義。結論兩種進化分支C4亞型EV71病毒的3D蛋白,共有22個位點氨基酸變異,其生物學意義有待進一步研究。
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