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中國流行的兩個(gè)進(jìn)化分支C4亞型EV71病毒3D蛋白氨基酸變異分析
朱穎; 翁育偉 福建省疾病預(yù)防控制中心(福建省人獸共患病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室); 福建福州350001
關(guān)鍵詞：腸道病毒71型 3d蛋白 氨基酸 變異
摘要：目的分析不同進(jìn)化分支腸道病毒71型(EV71)的3D蛋白氨基酸序列的差異,了解潛在毒力相關(guān)變異位點(diǎn)。方法從GenBank和實(shí)驗(yàn)室收集C4基因亞型EV71全基因序列,以VP1序列做進(jìn)化分析,統(tǒng)計(jì)分析C4a和C4b兩進(jìn)化分支EV71病毒的3D蛋白氨基酸序列。結(jié)果共收集病毒序列301株C4型EV71毒株,其中C4a序列293株、C4b序列8株。不同進(jìn)化分支中3D區(qū)有22個(gè)氨基酸殘基分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論兩種進(jìn)化分支C4亞型EV71病毒的3D蛋白,共有22個(gè)位點(diǎn)氨基酸變異,其生物學(xué)意義有待進(jìn)一步研究。
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