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蘿卜蚜有翅型和無翅型轉錄組差異分析
張秋圓; 李昭; 張慧杰; 王小平; 朱智慧 華中農(nóng)業(yè)大學植物科學技術學院/湖北省昆蟲資源利用與害蟲可持續(xù)治理重點實驗室; 武漢430070
關鍵詞：蘿卜蚜 轉錄組 生物信息學分析 差異表達基因
摘要：采用Illumina測序平臺獲得了蘿卜蚜轉錄組數(shù)據(jù),有翅蚜和無翅蚜混合樣本共得到107992806條CleaningReads,組裝得到69588條Unigene序列,平均長度為716bp。有翅蚜測序結果共得到44620184條CleaningReads;無翅蘿卜蚜測序結果共得到47113716條CleaningReads。2組樣品差異表達基因的分析表明共有顯著性差異表達基因104個,其中表達上調基因有74個,表達下調基因有30個。對差異表達基因進行GO注釋及KEGG富集分析顯示,Hippo信號通路、甲狀腺激素信號通路和催產(chǎn)素信號通路與翅型分化及與之緊密聯(lián)系的生殖率差異相關性較強。
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