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NCOA2促進(jìn)急性B淋巴細(xì)胞白血病細(xì)胞增殖及下游信號(hào)通路的生物信息學(xué)分析
關(guān)鍵詞：急性b淋巴細(xì)胞白血病 ncoa2 細(xì)胞增殖 生物信息學(xué)
摘要：目的探討核受體輔激活因子2(Nuclear Receptor Coactivator2,NCOA2)在急性B淋巴細(xì)胞白血病(B-ALL)細(xì)胞增殖中的作用,并利用生物信息學(xué)方法探究NCOA2促進(jìn)B-ALL細(xì)胞增殖涉及的基因和信號(hào)通路。方法在B-ALL細(xì)胞Nalm6及BALL-1中使用siRNA技術(shù)敲減NCOA2,通過Western blot檢測(cè)NCOA2的敲除效率,通過EdU方法檢測(cè)Nalm6及BALL-1細(xì)胞的增殖能力變化;使用GEO2R軟件分析NCOA2敲減細(xì)胞系的表達(dá)譜數(shù)據(jù)(GSE118992),找到有意義的差異基因;使用DAVID和KOBAS軟件對(duì)差異基因進(jìn)行GO和KEGG分析,對(duì)差異基因的作用和參與的信號(hào)通路進(jìn)行聚類分析;使用Venny2.1軟件對(duì)GO和KEGG中參與調(diào)控細(xì)胞增殖的因子進(jìn)行并集分析;使用STRING軟件分析參與NCOA2調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖相關(guān)基因之間的相互作用關(guān)系。結(jié)果NCOA2siRNA能夠抑制NCOA2蛋白表達(dá)和Nalm6及BALL-1細(xì)胞的增殖能力,同時(shí)篩選出受其調(diào)控的差異顯著性基因322個(gè),選擇排在前十位的生物學(xué)功能和信號(hào)通路,把其中參與調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖的基因取并集,找到受NCOA2調(diào)控的參與細(xì)胞增殖的4個(gè)基因(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),發(fā)現(xiàn)它們之間具有相關(guān)作用關(guān)系。結(jié)論NCOA2調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖相關(guān)因子(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),參與B淋巴細(xì)胞白血病發(fā)生發(fā)展。
解剖科學(xué)進(jìn)展雜志要求:
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{2}來稿需包括文章名、內(nèi)容提要、關(guān)鍵詞。內(nèi)容提要需能簡明扼要、客觀準(zhǔn)確地體現(xiàn)出論文的主要觀點(diǎn)；關(guān)鍵詞要以分號(hào)分隔并列。
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