購物車(0)
阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶點的生物信息學分析
關鍵詞：阿司匹林 人乳腺癌 生物信息學 細胞周期 細胞分裂
摘要：目的基于生物信息學分析大量公共數據庫,探討阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的分子機制。方法利用Drug Bank 5.1.3搜索確定阿司匹林的直接靶點蛋白(DPTs),STRING在線構建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)網絡和信號通路;使用cBio Portal研究人乳腺癌中DPTs基因突變,并利用OncoPrint可視化;從TCGA數據庫下載乳腺癌與正常組織中的轉錄組數據,利用DECenter分析差異過表達基因,對STRING分析得到的DPTs相互關聯(lián)基因與TCGA中的差異過表達基因求交集,確認阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點,并利用Gene Ontology進行GO功能富集分析。最終通過蛋白免疫印跡實驗驗證阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點。結果搜索Drug Bank 5.1.3確定了11個阿司匹林DPTs,KEGG通路富集表明其中6個DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2和TP53)與癌癥發(fā)生發(fā)展有關。通過分析TCGA數據庫中乳腺癌與正常組織中的轉錄組數據獲得10220個過表達差異基因,與STRING分析得到的6個阿司匹林DPTs的相互關聯(lián)基因求交集,發(fā)現(xiàn)4個基因(CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1)可能是阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點,其基因功能主要富集于細胞周期與細胞分裂。蛋白免疫印跡實驗結果顯示:阿司匹林可以降低人乳腺癌細胞中CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1的蛋白表達。結論CDC25C,TPX2,CDC20和PLK1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點,其可能通過影響細胞周期和細胞分裂發(fā)揮抗腫瘤增殖作用。
南方醫(yī)科大學學報雜志要求:
{1}獲得基金資助的文章應在文章首頁地腳以“基金項目”作為標志注明項目名稱及編號，并附項目證書復印件。
{2}本刊收到投稿后，會及時進行送審等工作，如逾3個月無回音，作者可自行處理，請勿一稿多投. 編輯部對錄用稿件有權作技術性和文字上的修改。
{3}論文題目和各級標題應簡潔、準確，20個字以內為宜；避免使用非公知、公用的縮略詞及代號。
{4}參考文獻應標明所引用文獻的著者姓名、書名、出版地名、出版社名、出版時間、頁碼等。
{5}文稿需附加中、英文摘要和關鍵詞。中文摘要一般不超過400 字，關鍵詞5～8 個，中、英文需對應。
注：因版權方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
