基于蠕形螨幾丁質(zhì)合成酶基因的PCR-RFLP及序列進化分析
關(guān)鍵詞：蠕形螨 幾丁質(zhì)合成酶
摘要：檢測33份來自上海地區(qū)的蠕形螨病犬毛囊樣品,其中能成功檢測出幾丁質(zhì)合成酶基因16株,與參考序列比對結(jié)果顯示,16株樣本株出現(xiàn)6類序列,其中9株沒有發(fā)生突變,所有序列之間同源性在99.7%~99.9%,與其他參考株同源性在98.2%~100%之間?；趲锥≠|(zhì)合成酶基因序列的遺傳進化分析顯示,6類序列分為2組,其中第3類序列單獨為1組,第1、2、4、5、6類序列與日本、印度、陜西株為1個組。利用Cfr13I、BSPT1、HinfI、Eco131I對6類序列的擴增產(chǎn)物進行酶切,Cfr13I酶切可將第3類序列與其他序列區(qū)分開來,HinfI和BSPT1酶切可將第2類序列區(qū)分開來,而第1、4、5、6類序列由于序列之間同源性較高,除了突變的位點無法找到特異的酶切位點之外,即使存在酶切位點也無法準確地將不同序列區(qū)分開。由于Genbank關(guān)于蠕形螨的序列研究較少,已有序列之間同源性較高,可供RFLP序列分析的基因較少,本次試驗將PCR-RFLP分子標記技術(shù)成功應(yīng)用于蠕形螨研究,蠕形螨幾丁質(zhì)合成酶測序和酶切結(jié)果可用于蠕形螨的物種鑒定、親緣關(guān)系及進化研究。
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