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大豆蛋白編碼基因起源與進化
關鍵詞：被子植物 基因復制 基因家族 基因起源 大豆
摘要：物種基因組成是一個高度動態(tài)的進化過程,其中相對較近起源的種系和物種特異性基因會持續(xù)整合到包含古老基因的原始基因網(wǎng)絡中。新基因在塑造基因組結構中發(fā)揮重要作用,能提高物種適應性。基因復制和新基因的從頭起源是產(chǎn)生新基因及改變基因家族大小的2種方式。目前,大豆(Glycine max)基因起源時間與進化模式的相互聯(lián)系很大程度上還未被探索。該研究選擇19種具有代表性的被子植物基因組,分析基因含量動態(tài)性與大豆基因起源之間的潛在聯(lián)系。采用基因出現(xiàn)法,研究顯示約58.7%的大豆基因能追溯到大約1.5億年前,同時有21.7%的基因為最近起源的orphan基因。研究結果表明,與新基因相比,古老基因受到更強的負選擇壓并且更加保守。此外,古老基因的表達水平更高且更可能發(fā)生選擇性剪切。此外,具有不同拷貝數(shù)的基因在上述特征中也具有明顯差異。研究結果有助于認識不同年齡基因的進化模式。
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